Môžu sa rezať aj molekuly

Dajú sa rezať aj molekuly? 

S rozvojom a vyspelosťou technológie sekvenovania novej generácie (NGS) sa rozsah aplikácie v rôznych trhových oblastiach vedeckého výskumu, diagnostiky a fyzikálneho vyšetrenia neustále rozširuje. V súčasnosti, s neustálym rozvojom trhu, sa rýchlosť vývoja samotnej sekvenačnej technológie postupne spomaľuje a úzky efekt prípravy vzoriek v NGS je čoraz zreteľnejší. Zároveň sa neustále vyvíjajú nové metódy zamerané na menšie objemy spracovania vzoriek, no fragmentácia DNA je vždy nevyhnutným krokom v procese výstavby knižnice NGS.

Ultrazvuková fragmentácia, založená na hydrodynamickom strihu a ultrazvukovej fragmentácii, je najbežnejšou metódou fragmentácie DNA. Princíp je nasledovný: pôsobením vysokofrekvenčných impulzov kvapalina vytvára nespočetné množstvo vysokotlakových a nízkotlakových bodov a sprievodné kavitačné bubliny existujú niekoľko milisekúnd a prasknú v dôsledku zmien tlaku. Pri tomto procese sa v kvapaline vytvára okamžitá vysoká pevnosť v šmyku. sila, ktorá môže rozbiť bunky, ovplyvniť proteíny a prerezať DNA. Tu je špeciálny produkt spoločnosti Xinzhi Bio: SCIENTZ18-Ultrazvukový nástroj na prerušenie DNA, ktorý využíva bezkontaktnú pracovnú metódu a dokáže spracovať až 12 vzoriek naraz. Ide o imunoprecipitáciu chromatínu (Chromatin Immunoprecipitation, ChIP) a štandardizovaný nástroj pre platformy výskumu strihania DNA.